Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SMS-202ENST00000404933 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FOXP1-205ENST00000468577 1842 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SPRYD3-204ENST00000547837 1655 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNF571-206ENST00000593133 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LMOD3-203ENST00000489031 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FP565260.3-202ENST00000623960 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 GNE-203ENST00000447283 2174 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 STAM-AS1-201ENST00000563601 2595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RAB37-212ENST00000528438 1494 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC010867.1-201ENST00000558038 2289 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PDHA1-204ENST00000379806 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CLN3-238ENST00000569430 3867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TACC2-204ENST00000360561 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 Z94160.1-201ENST00000445088 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SLC26A8-208ENST00000490799 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MAGEA9B-203ENST00000595065 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LINC00954-201ENST00000433669 2472 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 NEK6-203ENST00000373600 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CNDP2-202ENST00000324301 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LINC01238-203ENST00000429456 2170 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC092669.1-202ENST00000449673 905 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL160287.1-203ENST00000637960 1061 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 COL25A1-202ENST00000399127 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KBTBD12-201ENST00000343941 4121 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SPOP-202ENST00000393328 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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