Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
U3KQE9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
U3KQE9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
U3KQE9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U3KQE9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U3KQE9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U3KQE9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U3KQE9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms