Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MAP3K4Q9Y6R4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MAP3K4Q9Y6R4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms