Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00312Q9Y6C7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms