Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR2E3Q9Y5X4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NR2E3Q9Y5X4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms