Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX9Q9Y5X1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX9Q9Y5X1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX9Q9Y5X1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms