Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP16Q9Y5T5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP16Q9Y5T5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP16Q9Y5T5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms