Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COL4A3BPQ9Y5P4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL4A3BPQ9Y5P4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms