Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNPO3Q9Y5L0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNPO3Q9Y5L0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms