Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
R3HCC1Q9Y3T6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
R3HCC1Q9Y3T6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms