Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HCN4Q9Y3Q4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCN4Q9Y3Q4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms