Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V0

C15orf41, Uncharacterized protein C15orf41, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf41Q9Y2V0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C15orf41Q9Y2V0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C15orf41Q9Y2V0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms