Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATF5Q9Y2D1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATF5Q9Y2D1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms