Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITM2BQ9Y287 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITM2BQ9Y287 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms