Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM50BQ9Y247 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM50BQ9Y247 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM50BQ9Y247 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms