Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms