Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORCS3Q9UPU3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS3Q9UPU3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms