Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC8A2Q9UPR5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC8A2Q9UPR5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms