Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP18Q9UMW8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP18Q9UMW8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
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