Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHTF1Q9UMS5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHTF1Q9UMS5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms