Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIZ1Q9ULV3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CIZ1Q9ULV3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CIZ1Q9ULV3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CIZ1Q9ULV3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CIZ1Q9ULV3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIZ1Q9ULV3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIZ1Q9ULV3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIZ1Q9ULV3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIZ1Q9ULV3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms