Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAPPC2LQ9UL33 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC2LQ9UL33 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms