Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO4Q9UKT5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FBXO4Q9UKT5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms