Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERG28Q9UKR5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ERG28Q9UKR5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERG28Q9UKR5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms