Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AKAP11Q9UKA4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AKAP11Q9UKA4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms