Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDC23Q9UJX2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDC23Q9UJX2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms