Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPUSD1Q9UJJ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPUSD1Q9UJJ7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms