Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNNA3Q9UI47 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNNA3Q9UI47 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms