Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms