Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPARGC1AQ9UBK2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPARGC1AQ9UBK2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms