Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ORC3Q9UBD5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ORC3Q9UBD5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms