Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMC3IPQ9P2W1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMC3IPQ9P2W1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms