Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SLAIN2Q9P270 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SLAIN2Q9P270 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SLAIN2Q9P270 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SLAIN2Q9P270 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms