Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SENP1Q9P0U3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms