Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKD2L1Q9P0L9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKD2L1Q9P0L9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKD2L1Q9P0L9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms