Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD4Q9NZQ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD4Q9NZQ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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