Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF12Q9NZN5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF12Q9NZN5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF12Q9NZN5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms