Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC9

SMARCAL1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAL1Q9NZC9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCAL1Q9NZC9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCAL1Q9NZC9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms