Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HOXC10Q9NYD6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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