Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VNN3Q9NY84 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VNN3Q9NY84 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VNN3Q9NY84 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms