Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT4Q9NX09 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDIT4Q9NX09 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDIT4Q9NX09 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms