Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FANCLQ9NW38 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCLQ9NW38 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms