Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIC8BQ9NVN3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RIC8BQ9NVN3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms