Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMP3Q9NV31 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP3Q9NV31 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMP3Q9NV31 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms