Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DCAF13Q9NV06 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DCAF13Q9NV06 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms