Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms