Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KCNIP2Q9NS61 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms