Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOPORSQ9NS56 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TOPORSQ9NS56 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOPORSQ9NS56 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms