Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RASSF1Q9NS23 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RASSF1Q9NS23 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms