Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ACSS2Q9NR19 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACSS2Q9NR19 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms